Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms