Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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