Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Susd1E9Q3H4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms