Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms