Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms