Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fndc1E9Q043 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Fndc1E9Q043 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fndc1E9Q043 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms