Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20425E9Q035 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20425E9Q035 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms