Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddx60E9PZQ1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms