Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scaf11E9PZM7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms