Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms