Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Brd1E9PZ26 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Brd1E9PZ26 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms