Protein–RNA interactions for Protein: E9PYH6

Setd1a, SET domain-containing 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1aE9PYH6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd1aE9PYH6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd1aE9PYH6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd1aE9PYH6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd1aE9PYH6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd1aE9PYH6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd1aE9PYH6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd1aE9PYH6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd1aE9PYH6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd1aE9PYH6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd1aE9PYH6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd1aE9PYH6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd1aE9PYH6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd1aE9PYH6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd1aE9PYH6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Setd1aE9PYH6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Setd1aE9PYH6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Setd1aE9PYH6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Setd1aE9PYH6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Setd1aE9PYH6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Setd1aE9PYH6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Setd1aE9PYH6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Setd1aE9PYH6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Setd1aE9PYH6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Setd1aE9PYH6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Setd1aE9PYH6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Setd1aE9PYH6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Setd1aE9PYH6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Setd1aE9PYH6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Setd1aE9PYH6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Setd1aE9PYH6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Setd1aE9PYH6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Setd1aE9PYH6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Setd1aE9PYH6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Setd1aE9PYH6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Setd1aE9PYH6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Setd1aE9PYH6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms