Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sptbn4E9PX29 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sptbn4E9PX29 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sptbn4E9PX29 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms