Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
4931408C20RikE9PWP9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4931408C20RikE9PWP9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms