Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm3298E9PW80 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3298E9PW80 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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