Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3002E9PW72 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms