Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc144bE9PVZ3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms