Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD3

Dchs1, Protocadherin-16, mousemouse

Predictions only

Length 3,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dchs1E9PVD3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dchs1E9PVD3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dchs1E9PVD3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dchs1E9PVD3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dchs1E9PVD3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dchs1E9PVD3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dchs1E9PVD3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dchs1E9PVD3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dchs1E9PVD3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dchs1E9PVD3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dchs1E9PVD3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dchs1E9PVD3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dchs1E9PVD3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dchs1E9PVD3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dchs1E9PVD3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dchs1E9PVD3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dchs1E9PVD3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dchs1E9PVD3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dchs1E9PVD3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dchs1E9PVD3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dchs1E9PVD3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dchs1E9PVD3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dchs1E9PVD3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dchs1E9PVD3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dchs1E9PVD3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dchs1E9PVD3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dchs1E9PVD3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dchs1E9PVD3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dchs1E9PVD3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms