Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc62E9PVD1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms