Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms