Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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