Protein–RNA interactions for Protein: E9PUQ3

AU019823, Expressed sequence AU019823, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU019823E9PUQ3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AU019823E9PUQ3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AU019823E9PUQ3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AU019823E9PUQ3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AU019823E9PUQ3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AU019823E9PUQ3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AU019823E9PUQ3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AU019823E9PUQ3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AU019823E9PUQ3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AU019823E9PUQ3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AU019823E9PUQ3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AU019823E9PUQ3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AU019823E9PUQ3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AU019823E9PUQ3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AU019823E9PUQ3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms