Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930444G20RikD3Z741 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930444G20RikD3Z741 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930444G20RikD3Z741 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930444G20RikD3Z741 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930444G20RikD3Z741 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930444G20RikD3Z741 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930444G20RikD3Z741 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930444G20RikD3Z741 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930444G20RikD3Z741 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930444G20RikD3Z741 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930444G20RikD3Z741 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930444G20RikD3Z741 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930444G20RikD3Z741 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930444G20RikD3Z741 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930444G20RikD3Z741 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930444G20RikD3Z741 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930444G20RikD3Z741 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
4930444G20RikD3Z741 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms