Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L6

Slc18b1, MFS-type transporter SLC18B1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18b1D3Z5L6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc18b1D3Z5L6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc18b1D3Z5L6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms