Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm5934D3Z4U6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm5934D3Z4U6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms