Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptrhd1D3Z4S3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms