Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms