Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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