Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
3425401B19RikD3Z1D3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
3425401B19RikD3Z1D3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms