Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf217D3YYI7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf217D3YYI7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms