Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Kif28pD3YXS5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms