Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms