Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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BC048679D3YXE9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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BC048679D3YXE9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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BC048679D3YXE9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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BC048679D3YXE9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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BC048679D3YXE9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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BC048679D3YXE9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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BC048679D3YXE9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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BC048679D3YXE9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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BC048679D3YXE9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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BC048679D3YXE9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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BC048679D3YXE9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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