Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc13D3YV10 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc13D3YV10 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms