Protein–RNA interactions for Protein: C0HKG6

Rnaset2b, Ribonuclease T2-B, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaset2bC0HKG6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaset2bC0HKG6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaset2bC0HKG6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaset2bC0HKG6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaset2bC0HKG6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaset2bC0HKG6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaset2bC0HKG6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaset2bC0HKG6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaset2bC0HKG6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaset2bC0HKG6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaset2bC0HKG6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaset2bC0HKG6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaset2bC0HKG6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaset2bC0HKG6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnaset2bC0HKG6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnaset2bC0HKG6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnaset2bC0HKG6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnaset2bC0HKG6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnaset2bC0HKG6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnaset2bC0HKG6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnaset2bC0HKG6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnaset2bC0HKG6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnaset2bC0HKG6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnaset2bC0HKG6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnaset2bC0HKG6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnaset2bC0HKG6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnaset2bC0HKG6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnaset2bC0HKG6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnaset2bC0HKG6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnaset2bC0HKG6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnaset2bC0HKG6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnaset2bC0HKG6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnaset2bC0HKG6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnaset2bC0HKG6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnaset2bC0HKG6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnaset2bC0HKG6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnaset2bC0HKG6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnaset2bC0HKG6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnaset2bC0HKG6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnaset2bC0HKG6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnaset2bC0HKG6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rnaset2bC0HKG6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rnaset2bC0HKG6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnaset2bC0HKG6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnaset2bC0HKG6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnaset2bC0HKG6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rnaset2bC0HKG6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rnaset2bC0HKG6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rnaset2bC0HKG6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Rnaset2bC0HKG6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Rnaset2bC0HKG6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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Rnaset2bC0HKG6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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Rnaset2bC0HKG6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rnaset2bC0HKG6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rnaset2bC0HKG6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnaset2bC0HKG6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnaset2bC0HKG6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnaset2bC0HKG6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms