Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprz1B9EKR1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprz1B9EKR1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms