Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cttnbp2B9EJA2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms