Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm20547B8JJN0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm20547B8JJN0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm20547B8JJN0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm20547B8JJN0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm20547B8JJN0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm20547B8JJN0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm20547B8JJN0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm20547B8JJN0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20547B8JJN0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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