Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms