Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms