Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cped1B2RX70 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cped1B2RX70 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Cped1B2RX70 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cped1B2RX70 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cped1B2RX70 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cped1B2RX70 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cped1B2RX70 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cped1B2RX70 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cped1B2RX70 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cped1B2RX70 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms