Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usf3B2RUQ2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usf3B2RUQ2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usf3B2RUQ2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usf3B2RUQ2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usf3B2RUQ2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usf3B2RUQ2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Usf3B2RUQ2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf3B2RUQ2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Usf3B2RUQ2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Usf3B2RUQ2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usf3B2RUQ2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usf3B2RUQ2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usf3B2RUQ2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usf3B2RUQ2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usf3B2RUQ2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usf3B2RUQ2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usf3B2RUQ2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usf3B2RUQ2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usf3B2RUQ2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usf3B2RUQ2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usf3B2RUQ2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usf3B2RUQ2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usf3B2RUQ2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usf3B2RUQ2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usf3B2RUQ2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usf3B2RUQ2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usf3B2RUQ2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usf3B2RUQ2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usf3B2RUQ2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usf3B2RUQ2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usf3B2RUQ2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Usf3B2RUQ2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usf3B2RUQ2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Usf3B2RUQ2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms