Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms