Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Otud4B2RRE7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms