Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ythdc2B2RR83 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ythdc2B2RR83 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms