Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1B2KF50 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1B2KF50 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms