Protein–RNA interactions for Protein: B1AYN9

Tex28, Testis-expressed 28, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tex28B1AYN9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tex28B1AYN9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tex28B1AYN9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tex28B1AYN9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tex28B1AYN9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tex28B1AYN9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tex28B1AYN9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tex28B1AYN9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tex28B1AYN9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tex28B1AYN9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tex28B1AYN9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tex28B1AYN9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tex28B1AYN9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tex28B1AYN9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tex28B1AYN9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tex28B1AYN9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tex28B1AYN9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tex28B1AYN9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tex28B1AYN9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tex28B1AYN9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tex28B1AYN9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tex28B1AYN9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms