Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mbd5B1AYB6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mbd5B1AYB6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms