Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scml2B1AVB3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scml2B1AVB3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms