Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trabd2bB1ATG9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms